Ich habe das Problem genau anders herum: Nach dem Wiedereinschalten des Vista-PCs aus dem Standby-Modus klappt alles prima. Nach dem Wiedereinschalten aus einem "tieferen Schlafmodus" (Ruhezustand), nach einer Stunde oder längerem Standby, werden die Tastatur und die Maus nicht mehr erkannt.
Funktastatur und Funkmaus werden über ein Funkmodul per USB angebunden (Microsoft Wireless Comfort Keyboard 1.0A). Dann hilft es nur, den Computer per Netzschalter neu hochzufahren. Statt Wiederaufwachen aus Standby erscheint dann "Windows wird fortgesetzt". Auch jetzt sind Tastatur und Maus noch nicht verfügbar. Erst nach einem neuerlichen Neustart per Netzschalter fährt die Kiste komplett neu hoch und erkennt dann auch die Tastatur wieder.
So geschehen unter Windows Vista Home Premium sowie auch nach einem Upgrade auf Ultimate.